Las votaciones sobre las medidas se producirán después de que los legisladores rechazaran el martes un último intento del presidente de la Cámara para impedirlas.
Petro ha criticado reiteradamente a Trump por sus políticas hacia Venezuela, Cuba y Gaza, así como por sus posturas sobre migración y cambio climático.
La mandataria instruyó al canciller Juan Ramón de la Fuente a contactar al Departamento de Estado para conocer los alcances de la orden ejecutiva de Trump.
El lunes, Trump anunció en redes sociales que la nueva tasa se aplicaría a automóviles, madera, productos farmacéuticos y a todos los demás aranceles recíprocos.
Los datos tienen en cuenta la caída del volumen exportado en los meses en los que se aplicó el arancel adicional de hasta el 50%, de julio a noviembre.
La decisión, anunciada por Trump el miércoles en redes sociales, supone un cambio radical para un presidente que intentó repetidamente coaccionar a Europa en los últimos días.